Přehled variant (převzato z ICEho článku SR-71 Blackbird - mimo dosah PVO)
A-12 - jednomístný průzkumný letoun pro CIA postaveno 15 (13) kusů, ztraceno 5.
A-12 trainer - dvoumístná cvičná varianta pro výcvik pilotů postaven 1 kus
YF-12A - stíhací varianta vybavená radiolokátorem AN/ASG-18 postaveny 3 kusy, ztraceny 2.
YF-12C - pod tímto označením, s číslem 60-6937 používala NASA SR-71A jehož původní číslo bylo 61-17951.
M-21 - nosič bezpilotních průzkumných letounů D-21. Přestavbou z A-12 byly postaveny 2 kusy, ztracen 1.
B-71 - plánovaná bombardovací verze F-12, pouze projekt
SR-71A - dvoumístný průzkumný letoun pro USAF postaveno 29 kusů, ztraceno 11.
SR-71B - cvičný letoun pro výcvik pilotů postaveny 2 kusy, ztracen 1.
SR-71C - náhradní cvičný letoun postavený z draku YF-12 s původním číslem 60-6934 s použitím upravené přídě SR-71 určeného pro "lámací" zkoušky
A-12 - jednomístný průzkumný letoun pro CIA postaveno 15 (13) kusů, ztraceno 5.
A-12 trainer - dvoumístná cvičná varianta pro výcvik pilotů postaven 1 kus
YF-12A - stíhací varianta vybavená radiolokátorem AN/ASG-18 postaveny 3 kusy, ztraceny 2.
YF-12C - pod tímto označením, s číslem 60-6937 používala NASA SR-71A jehož původní číslo bylo 61-17951.
M-21 - nosič bezpilotních průzkumných letounů D-21. Přestavbou z A-12 byly postaveny 2 kusy, ztracen 1.
B-71 - plánovaná bombardovací verze F-12, pouze projekt
SR-71A - dvoumístný průzkumný letoun pro USAF postaveno 29 kusů, ztraceno 11.
SR-71B - cvičný letoun pro výcvik pilotů postaveny 2 kusy, ztracen 1.
SR-71C - náhradní cvičný letoun postavený z draku YF-12 s původním číslem 60-6934 s použitím upravené přídě SR-71 určeného pro "lámací" zkoušky